目標 腸道微生物組構成與多種疾病相關，但其與長期結局指標的關係研究較少。 儘管腸道菌群失調已與普通人群死亡風險相關聯，其在特定疾病患者中與總體生存率的關係尚未深入探討。 本研究通過深入分析實體器官移植受者（SOTR）腸道菌群失調與全因及特定原因死亡率的關聯，提供重要實證。
設計 我們分析了來自TransplantLines生物樣本庫及佇列研究的1337份糞便樣本巨集基因組數據，涵蓋766名腎移植、334名肝移植、170名肺移植及67名心移植受者，該前瞻性佇列研究包含6.5年隨訪的詳細表型數據。 為評估腸道菌群失調，我們額外納入了同地區（荷蘭北部）8208例普通人群的巨集基因組數據。 通過多變數Cox回歸和機器學習演算法，分析包括單菌種豐度在內的多種菌群失調指標與全因及特定原因死亡率的關聯。
結果 我們識別出兩種表徵整體菌群群落變異的模式，均與全因及特定原因死亡率相關。 每位移植受者與普通人群平均菌群的差異距離與全因死亡率及感染、惡性腫瘤和心血管疾病導致的死亡相關。 多變數Cox回歸分析發現23種細菌菌種與全因死亡率顯著關聯; 通過機器學習演算法，進一步篩選出其中19種菌種構成的平衡比值（一種對數比率），該比值模型與全因死亡率存在明確關聯。
結論 腸道菌群失調在實體器官移植受者中持續與死亡率相關，支援菌群失調影響長期生存的現有觀察。 鑒於本研究數據無法推斷因果關係，需開展更多臨床前研究以闡明作用機制，方能確定是否可設計腸道微生物組靶向療法以改善長期預後。
- 腸道微生物學
- 肝臟移植
數據可用性聲明
數據可根據合理請求獲取。 本研究使用的原始微生物組測序數據及基礎表型數據已存入歐洲基因組-表型組檔案庫，登錄號為EGAD00001008907、EGAS00001006257和EGAS00001006258。 出於患者隱私保護，與巨集基因組數據集關聯的臨床數據集需向格羅寧根大學醫學中心申請獲取。 數據訪問需通過電子郵件（datarequest.transplantlines@umcg.nl）提交數據訪問申請表，審核將在兩個工作周內完成。 該流程旨在確保數據僅用於科研目的，符合TransplantLines參與者簽署的知情同意書要求，明確禁止數據用於商業用途。
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SJLB、RKW和JRB構思並設計研究專案; JCS、SJLB和RKW獲取研究資助; TJK、JCS、HB、EAMV、TCG和SJLB負責樣本採集; JCS和JRB進行數據分析與解讀; JCS、JRB、SJLB和RKW起草論文; JCS、RG、RKW和JRB修訂論文; SZ、LMN、RG、TJK、VEDM、KD、EAMV、TCG、JF、AZ、HJMH和HB參與論文關鍵審閱; JCS、SJLB、JRB和RKW對研究工作負全責。 全體作者批准論文最終版本。
- 資金支援 本研究獲荷蘭經濟事務與氣候政策部、Seerave基金會、Chiesi Farmaceutici（項目號PA-SP/PRJ-2020-9136）、Astellas BV、荷蘭研究理事會（NWO/TTW/DSM項目號14939）及歐盟地平線歐洲計劃（miGut-Health 101095470）資助。
- 利益衝突聲明 TransplantLines生物樣本庫研究獲Astellas BV和Chiesi Pharmaceuticals BV資助; RKW獲Seerave基金會、荷蘭研究理事會及歐盟地平線歐洲計劃（miGut-Health專案）支援; JF獲荷蘭心臟基金會、歐洲研究理事會、荷蘭研究理事會及荷蘭器官晶元計劃資助。
- 患者及公眾參與 本研究設計、實施、報告及傳播計劃均未涉及患者或公眾參與。
- 研究來源與同行評審 非約稿; 經外部同行評審
