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適度玩電遊或有益心理健康

《自然·人类行为》19日发表的一项基于日本97602人数据并结合机器学习演算法的研究显示,拥有电子游戏机并参与游戏,可能会对心理健康产生积极影响,但时间不宜过长。

通常认为,电子游戏会对心理健康产生负面影响,世界卫生组织已经将游戏障碍列为健康问题。但关于电子游戏和心理健康的关系,大多数现有科学证据并没有在二者之间建立强烈的关联。

由于2020年至2022年游戏机短缺,日本的零售

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商用抽签的方式为消费者提供两种不同的游戏机。日本大学研究团队此次​​利用这种随机分配评估了电子游戏对压力和生活满意度的影响。他们调查了97602人(其中8192人参与了游戏机抽签),他们的年龄在10—69岁。调查收集了受访者是否参与抽奖、拥有游戏机的情况、游戏偏好、心理健康、生活满意度以及社会人口特征等资讯。

团队采用专为推断调查数据因果关系而设计的机器学习演算法,发现拥有一台游戏机和在其中一台游戏机上玩游戏,都会改善心理健康。但每天玩游戏超过3小时的人不再获得同等益处。研究也发现,拥有游戏机能提高生活满意度,减少心理痛苦。

研究人员表示,这项发现也凸显了萤幕使用时间对心理健康的复杂影响。

カテゴリー: 2生活常識 | 投稿者booty2 17:53 | コメントをどうぞ

攝護腺癌患者血液內檢出新型RNA

美国西奈山伊坎医学院科学家在前列腺癌患者的血液内检测出一些新型RNA,被包裹在名为「细胞外囊泡」的奈米颗粒内。当癌症存在时,这些分子会发生变化,这表明它们有可能成为检测前列腺癌的生物标记或治疗标靶。相关论文发表于

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最新一期《细胞外囊泡期刊》线上版。

研究团队将这些RNA分子命名为「EV-UGR」(细胞外囊泡相关未注释基因组区)。未注释基因组区(UGR)通常被称为人类基因组的“暗物质”,对控制基因开关及遗传指令如何转化为蛋白质至关重要。

细胞外囊泡和外泌体是微小的奈米颗粒,仅为人类头发宽度的千分之一,由细胞分泌到血液和尿液等生物流体中。研究团队发现,细胞外囊泡携带一些先前未被辨识的RNA暗物质小片段。

为了辨识这些新型RNA,研究团队使用下一代小RNA定序技术快速分析人体组织和液体样本。他们还开发了一种具有成本效益的液体活检方法,并创建了从血液和尿液中分离微小细胞外囊泡的工具。结果显示,在癌症存在的情况下,血液EV-UGR会改变。这表明,医生或许可透过简单的非侵入性液体检测,诊断前列腺癌。

カテゴリー: 2生活常識 | 投稿者booty2 17:52 | コメントをどうぞ

微生物抗藥性:人類健康的重大威脅2

「生物炭」方法阻断抗药性传播

找到抗药性基因的污染源头后,团队进一步发现,中水回用和堆肥,会导致土壤中部分抗药性基因的扩散和富集。同时,他们发现,污泥和动物粪肥的长期施用,会增加土壤抗药性基因的多样性和丰度。

污水处理厂的污泥,需要经过相应的处理才能施用于土壤中,堆肥是主要的处理方法。 「我们原以为高温堆肥能杀死污泥中的病原菌,减少抗药性基因。然而,在研究污泥堆肥过程中抗药性基因的变化时,我们发现堆肥后期抗药性基因反而增多了。」苏建强说,「我们继而探讨其中可能的原因,这个结果促使我们关注到有机堆肥中的抗药性基因问题。”

事实上,人类活动排放的抗生素及抗生素抗

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药性基因与人类、动物、环境共享一个微生物世界,并透过微生物循环传播。

「研究团队曾经采集了多个餐厅中生食蔬菜沙拉样品,发现人们每食用300克的生食蔬菜,可摄取约109数量级拷贝数的抗生素抗药性基因。」朱永官告诉记者,这说明用带有抗性基因有机肥浇灌的蔬菜也会带有抗药性基因。这些基因会透过食物链传递到人体。他进一步解释,环境中的微生物群落非常复杂,如1克土壤中就含有约10亿个微生物,它们之间无时无刻不发生基因的水平转移,这个过程使抗生素抗药性基因转移和扩散。

为解决有机堆肥导致的抗药性基因扩散问题,团队有针对性地开发出「生物炭」土壤污染治理方法,即利用600℃及以上的高温对猪粪或鸡粪进行炭化处理,使其中的抗生素和抗药性基因分解。这项原始成果可以在动物粪便进入环境之前,将其变成生物炭,从而减少土壤中的抗药性基因污染。目前,「生物炭」土壤污染治理方法已经走出实验室,走上生产线,成为销往世界的产品。

今年6月,由朱永官领衔的「环境中抗药性基因的形成与扩散机制」计画荣获全国自然科学奖二等奖。这项荣誉充分肯定了团队在抗药性基因环境污染研究领域所取得的成就。

目前,除了「生物炭」土壤污染治理方法,高温堆肥技术、水体高级氧化技术、电化学技术等的发展也为管控和减少环境抗药性基因污染提供了有效手段。此外,噬菌体疗法作为一种自然的生物消减技术,为减少环境中的抗性基因带来了新的希望与前景。

遏制微生物抗药性任重道远

作为一类新型微生物污染物,环境中的抗药性基因日益受到国际社会的关注。 2016年,世界卫生组织、联合国粮农组织等明确指出,应启动全球行动计划,重点关注抗药性在「人—动物—环境」中的传播和扩散问题。

2022年,我国国家卫生健康委员会、生态环境部、农业农村部等13个部门联合印发了《遏制微生物抗药性国家行动计画》,强调环境中细菌抗药性研究的重要性,并要求各政府部门和产业加强协作,从多个领域出发,打出组合拳,共同应对这项挑战。

那么,究竟该如何因应微生物抗药性风险呢?

「源头上把控、过程中控制、末端上修复。」朱永官说,应对微生物抗药性风险,要从这三个层面应对,即源头严格把控抗生素的使用和污水排放,过程中控制抗药性基因的传播扩散,在末端则要进行修复治理。

「我们的研究成果发布

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以后,受到国内外的广泛关注。 」苏建强说,团队发表的相关研究论文连续几年成为被引热点论文,相关原创成果促使世界各地采取措施。同时,基于团队建构的高通量定量PCR检测平台,我国团队与英、德、美、澳等国的同行建立了广泛合作。

目前,科学家已对环境中抗药性基因进行了一些基础研究并获得了一定数据,但对环境中抗药性基因的全面系统研究仍显不足。抗药性基因从哪里来、到哪里去、风险如何,以及具体采取哪些因应措施,仍有待科学研究作出系统性回答。

「我国是最早发布和实施《遏制细菌抗药性国家行动计画》的国家之一。遏制微生物抗药性已经上升到国家安全和重大战略高度,不再局限于某个行业或某个专业领域。」国家卫生健康委医政司副司长李大川曾表示,由于不同地区间、不同医疗机构间的服务能力、管理水准仍有较大差异,微生物抗药性问题情势仍严峻复杂,还需要进一步强化抗微生物药物合理应用管理,提升医疗卫生和动物卫生专业人员微生物抗药性防治能力,提升全社会对微生物抗药性的认知水准。

「废弃物排放导致的抗生素抗药性,正是人类在微生物世界留下的『足迹』。我们要做的是尽可能让这类『足迹』少一些。」朱永官强调,抗药性基因向活菌再向病原菌过渡、复合污染以及宿主与微生物组之间的相互作用,是人们当前面临的新挑战、新课题,科研人员与微生物病学的「战争」,仍在继续。

カテゴリー: 2生活常識 | 投稿者booty2 17:50 | コメントをどうぞ

微生物抗藥性:人類健康的重大威脅

「我家孩子从来没使用过阿奇霉素,咋也抗药性了?」今年8月初,在福建省厦门市思明区莲前街道社区卫生服务中心,家长李华向医生表达了自己的疑惑。

在儿科门诊,儿童家长常向医师提出这个问题。事实上,不仅是儿童,很多人都被这个问题困扰。

微生物抗药性,特别是细菌的抗药性,已被世界卫生组织列为严重威胁人类安全的公共卫生问题之一。多重抗药性细菌的增加和扩散,使标准化治疗成效甚微。

「环境是抗药性基因的储存库,也是细菌抗药性传播的重要媒介。」中国科学院院士、中国科学院城市环境研究所所长朱永官在接受记者采访时表示,诸如抗生素滥用、集约化养殖以及生活污水排放等人类活动,正在加剧环境中抗药性基因的扩散与传播,进一步导致人群暴露在抗药性污染的环境中。

为解决这个迫切问题,科学家和公共卫生专家积极寻找解决方案,一场微生物界「无硝烟的战争」已然打响。

药物为什么“失效”

抗生素作为对抗细菌感染的关键武器,已挽救了数亿人的生命。然而,全球的临床医生如今正面临一个日益严峻的问题:曾经「药到病除」的药物对某些细菌开始失去效用。

「例如用于治疗支原体肺炎、百日咳等疾病的大环内​​酯类一线药物,治疗效果在逐年下降。」上海儿童医学中心医生张皓经过十多年的临床观察发现,相当一部分患儿应用阿奇霉素治疗后,效果走低,病程延长,且肺内病变持续发展。

导致这一系列问题的根本原因正是抗生素抗药性。抗生素抗药性,是指微生物对一种或多种原本有效的药物产生抵抗能力,即微生物对药物的敏感性降低,导致正常剂量的抗生素无法发挥应有的杀菌效果,甚至完全无效。

「如果把抗生素比喻为长矛,细菌的抗药性基因就相当于盾,能够防御抗生素的攻击。」复旦大学附属第五人民医院医院感染管理科副主任技师申春梅说,细菌对环境具有较强的适应能力,产生抗药性是其进化过程中自然选择的结果。人类社会对抗菌药物的滥用,正在加速细菌抗药性的产生,导致临床可选择的抗生素越来越少。这不仅抬高了医疗成本,也增加了病患的健康风险。

中国细菌抗药性监测网的最新报告显示,2023年上半年,抗药性菌株检出率呈上升趋势。其中,被世界卫生组织列为抗菌药物抗药性「重点病原体」的鲍曼不动杆菌,检出率更是升至78.6%—79.5%,刷新历史最高值。世界卫生组织相关数据显示,2019年,感染抗药性细菌直接造成127万人死亡,间接死亡人数达500万人;预计到2050年,每年将新增约1000万直接死亡人数,与2020年全球死于癌症的人数相当。

世界卫生组织前总干事陈冯富珍博士曾指出,

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随着多重抗药性细菌的不断增加和播散,普通感染也可能成为致命威胁。 「这并非危言耸听,当人类遭遇无药可用的困境时,即便是微不足道的伤口或是呼吸道感染,也可能带来致命后果。」她说。

自然环境成传播“中继站”

近年来,如何破解抗药性问题成为医学领域面临的重大挑战之一。相关研究围绕着抗药性分子遗传基础、转移机制等面向展开,以期深入理解微生物或细胞如何发展出抵抗能力,进而开发出新型药物、药物组合、疗法以及替代治疗手段,以应对现有药物失效的问题。

值得重视的是,即使个体从未使用过抗生素,抗药性情况也可能出现。 「抗药性的是细菌,而不是人体。」张皓进一步解释,抗药性的主体是微生物本身,换句话说,人体只是新型抗药性病菌的宿主。这意味着,抗药性的产生不仅和个体有关,更和人类群体及环境密切相关。

在个体层面,长期不当使用抗生素可导致细菌基因突变,进而产生抗药性。抗药性菌株在群体中透过接触传播,使得整个群体都面临抗药性风险。而更容易被忽略的是,环境中残留的抗药性基因,会加速抗药性菌株的产生与扩散。

2002年,朱永官在追溯土壤中的砷污染时,意外发现土壤中的动物粪便里也存在抗药性基因。在养猪场、养鸡场,为了让动物快速生长并防止其感染肠道疾病,饲料中会添加铜、锌、砷和抗生素等,这些重金属及抗生素抗药性基因会透过动物粪便排放到环境中。

「抗药性基因是遗传讯息,可以被复制。」朱永官敏锐地意识到,不同于过去研究的化学污染,由于添加抗生素导致细菌抗药性的生物污染可能是一个更严重的环境污染问题。很快,朱永官逐渐把研究重心从砷调整到抗药性基因上,当时这一领域的相关研究在国际上尚属空白。

「环境中的抗药性基因与医学中的抗药性基因一样,都是一段核苷酸序列,编码抗药性状。但这些抗药性基因可以在『人类—动物—环境』间扩散,并可能转移到病原菌中,使病原菌形成新的或多重抗药性表型,从而影响抗生素疗效和人类健康。

此前,医学领域和动物养殖业已针对抗药性基因进行大量研究。而朱永官团队所进行的研究主要关注环境中的抗药性基因,其复杂性体现在抗药性基因在环境中的持久性存留、传播和扩散等多个环节。

「过去,我们主要关注医学领域和动物养殖业抗生素的使用情况,忽略了环境中的抗生素残留问题。实际上,河流、土壤甚至饮用水中都能检测到微量抗生素,自然环境成为抗药性基因传播的’中转站’。」苏建强说,环境在细菌抗药性过程中扮演着不容忽视的角色,因此,解决药物不仅应从临床视角扩展到

追寻抗药性基因污染源头

环境中存在的抗药性基因究竟从何而来?它们又是如何传播、扩散的?揭示抗药性基因在环境中的形成与扩散机制,对于控制抗药性的蔓延至关重要。

系统回答这个科学问题,先要摸清环境中抗药性基因的「家底」。为此,朱永官团队在国内进行了一场大规模采样调查。团队先后在全国26个省份采集了152个耕地或森林的土壤样本;又前往全国17个城市的32个污水处理厂,在城市排水高峰期开展采样工作,以摸清我国水土中抗药性基因的分布。

从土壤和污水样本中精准「揪出」抗药性基因并非易事。朱永官介绍,首先,环境中有数百种甚至数千种抗药性基因,而土壤和水体中的微生物群落又极其复杂,抗药性基因存在于各种微生物体内,这使得分离和鉴定工作难度极大。其次,传统检测方法无法准确辨识低浓度或新出现的抗生素抗药性基因,限制了抗药性基因研究的深度和广度。同时,海量的数据需要强大的生物资讯工具来处理,以准确解读抗药性基因的种类、丰度和潜在传播模式。

如何对大量环境样本中众多抗药

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性基因进行快速检测,成为团队进行研究的技术困难。为此,团队建构了抗药性基因的高通量定量聚合酶链式反应(PCR)检测平台。这个平台一次运作可对300多个抗药性基因进行定量检测,大幅提升了对抗药性基因的筛检和定量分析能力。该平台借助PCR技术,能大量复制特定的DNA片段,使定量分析更快速便捷,满足科学研究的需求。

「我们发现,有128种抗生素抗药性基因在超过80%的样本中存在。」朱永官介绍。

检测平台的搭建使朱永官团队在调查中快速取得进展:一是发现了人类活动与环境中的抗生素残存之间存在明显的正相关关系,在受人类扰动较大的耕地土壤中,抗生素耐药基因检出数量及丰度都显著高于森林土壤,同时,中东部人口密集区中检测到的耐药基因高于人口稀疏环境;二层是基本锁定在人口中的主要地区。

「我们随意丢弃的一粒药片,或人类或动物服用抗生素后排出的抗性微生物,都会随着废弃物进入环境。」朱永官解释道,透过微生物循环系统,抗药性基因从点源扩展到整个生态系统,使人群暴露在抗药性污染的环境中。

在这次情况下摸中,科学研究人员首次获得了20种我国环境中普遍存在的抗药性基因。这对理解抗药性基因的传播路径及潜在风险至关重要。

カテゴリー: 2生活常識 | 投稿者booty2 17:49 | コメントをどうぞ

「超級細菌」宿主體內演化法則揭示

记者22日从中国农业大学获悉,该校动物医学院沈建忠院士与复旦大学附属华山医院胡付品研究员团队,揭示了碳青霉烯抗药性高毒力肺炎克雷伯菌在单一宿主(包括患者和小鼠)尿道中进行适应性进化的现象,为理解该菌在宿主体内的生存策略提供了新视角,并为未来开发针对该类,并为未来开发针对该策略提供了新视角,并为未来开发针对该策略。相关成果日前发表于国际期刊《美国国家科学院院刊》。

7月31日,世界卫生组织发出警告,一类兼具高毒力和多重抗药性特征的「超级细菌」—碳青霉烯抗药性高毒力肺炎克雷伯菌正在全球蔓延。

论文共同通讯作者、中国农

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业大学教授吴聪明告诉科技日报记者,碳青霉烯抗药性高毒力肺炎克雷伯菌能引起动物(牛、犬猫等)和人的致命性感染,且几乎对临床上所有可选的抗生素耐药,其致死率接近35%,甚至更高。该菌可塑性强,面对各种环境压力能不断发生适应性演化。然而,对于该菌在宿主体内时间维度上的演化讯息,以及其体内演化是否由抗生素压力所驱动等问题,一直没有答案。

这项研究追踪了一名同时患有阴囊脓疡和尿道感染的患者,并分析了他在不同病程阶段尿液中分离的碳青霉烯抗药性高毒力肺炎克雷伯菌。研究首次揭示了碳青霉烯抗药性高毒力肺炎克雷伯菌在单例宿主尿道中以黏度表型转变为特征的适应性演化规律,并解析了这种黏度转变的分子机制。

カテゴリー: 2生活常識 | 投稿者booty2 17:48 | コメントをどうぞ

研究顯示原始細胞壁形成歸功於雨水

关于生命起源的一个主要未解之谜是,地球「原始汤」中漂浮的RNA液滴究竟如何演变成了被膜包裹的生命体-细胞。美国芝加哥大学和休士顿大学生物学家和工程师在发表于《科学进展》杂志的论文中提出了新见解。论文示范了38亿年前雨水如何帮助原始细胞形成网状壁,这是从微小的RNA珠滴演变为细菌、植物、动物和人类的关键一步。

研究探讨了一种由蛋白质、脂质和RNA等复杂分子自然形成的隔间,称为「凝集体液滴」。这些液滴就像是水中的油滴,长期以来被视为第一批原始细胞的候选人。

任何包含新的、可能有用的RNA前生命突变的液滴,都会在几分钟内与其他RNA液滴交换这种RNA,这意味着它们很快就会变得相同。这样就不会有分化和竞争带来的演化,也意味着没有生命。

研究人员发现,含有早期RNA形式的凝集体液滴中,RNA交换得太快。他们假设,蒸馏水对凝集体液滴的影响可能与地球上生命的起源有关。而38亿年前蒸馏水可能存在的方式就是雨水。

实验发现,将凝集体液滴转

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移到蒸馏水中可延长RNA交换的时间,从几分钟延长到几天。这段时间足以发生突变、竞争和进化。

将凝集体液滴转移到蒸馏水中,液滴周围就会形成一层较硬的“皮肤”,从而限制它们交换RNA。当它们稳定下来,不再交换遗传物质,就能很好地储存自己的遗传讯息。该状态至少持续几天,保证其遗传序列中发生突变,一个族群就可实现进化。

在利用真实雨水和模拟雨水进行的实验中,研究人员发现了相同结果:雨水形成了原始细胞周围网状壁,创造了可能孕育生命的条件。

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調控壽命的新基因被發現

近日,记者从西南大学获悉:该校资源昆虫高效养殖与利用全国重点实验室代方银教授团队发现了调控寿命的新基因OSER1,并在家蚕等多物种研究中揭示了其延缓衰老和延长寿命的保守性机制。相关研究成果近日已在国际学术期刊《自然通讯》线上发表。

  代方银介绍,叉头框蛋白O是目前已确定的少数人类长寿基因之一,能调节与老化相关的途径从而影响寿命。然而,介导这些影响的标靶暂不明确。对此,研究团队首先查明,叉头框蛋白O在不同模式动物间的二级结构具有较高保守性,这为利用家蚕筛选叉头框蛋白O标靶基因提供了依据。

  研究团队在家蚕中鉴定到叉头框

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蛋白O的42个候选标靶基因,然后利用线虫高效干涉平台,对这些候选标靶基因在线虫的同源基因进行干涉实验。结果发现,线虫的OSER1同源基因表现降低后,寿命缩短幅度最大。

  「对线虫、家蚕、果蝇、斑马鱼、非洲爪蟾、小鼠、恒河猴与人类进行比较分析,发现其基因组中均存在OSER1的直系同源基因。」论文第一作者、西南大学资源昆虫高效养殖与利用全国重点实验室副教授宋江波说,提高OSER1表达后,家蚕、线虫和果蝇3个物种的寿命均显著延长。

  为了阐释OSER1调节长寿的作用机制,研究团队在家中蚕、线虫和果蝇中进行了一系列分子生物学的实验。研究结果表明,OSER1是叉头框蛋白O的直接目标基因,能够响应过氧化氢诱导的氧化应激,并透过提升身体氧化压力防御力而延长寿命。

カテゴリー: 2生活常識 | 投稿者booty2 17:45 | コメントをどうぞ

患有糖尿病會加速大腦衰老

瑞典卡罗林斯卡医学院科学家进行的一项全面的脑成像研究表明,患有第2型糖尿病或处于糖尿病早期,会使患者的大脑「悄悄」加速衰老。不过,研究团队也强调,健康的生活方式可能有助于预防这些疾病所造成的神经系统变化。相关论文发表于近一期《糖尿病照护》杂志。

  2型糖尿病是痴呆症的已知危险因素,但糖尿病及其早期阶段如何影响痴呆症族群的大脑老化过程,至今仍是一个谜。最新脑部影像研究表明,第2型糖尿病和糖尿病前期都会导致患者的大脑加速老化。

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  研究人员让31,000多名40—70岁成年人接受了核磁共振影像脑部扫描。随后,他们利用机器学习技术来估算这些人的大脑年龄。结果显示,糖尿病早期患者大脑年龄平均比实际年龄老半岁;第2型糖尿病患者大脑年龄比实际年龄老2.3岁;糖尿病控制不佳患者大脑年龄比实际年龄老4岁。

  研究团队指出,这现象显示患者偏离了正常的老化过程,这可能是痴呆症的早期预警讯号。不过,有运动习惯且不大量吸烟或饮酒的参与者不太可能出现大脑加速老化的情况。

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五萬個人類結狀DNA現“真容” 為包括癌症在內的多種疾病開闢新療法

科技日报北京9月1日电(记者张梦然)DNA因其标志性的双螺旋结构而广为人知。但澳洲加文医学研究所科学家发现,人类基因组还含有超过5万个不寻常的结状DNA结构,称为i-基序。最新一期《EMBO》杂志发表了这些独特DNA结构的第一张综合图谱,揭示了它们在与疾病相关的基因调控中的潜在作用。

  2018年,加文医学研究所团队在一个里程碑式的研究中

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,首次使用他们开发的新抗体工具,直接在活的人类细胞内可视化i-基序。此次研究正是基于这些发现,利用同样的抗体来辨识整个基因组中的i-基序位置。

  本研究在人类基因组中确定了超过5万个i-基序的存在地点,这些位点在所研究的三种细胞类型中均有出现。这一数字对于曾经备受争议的DNA结构而言是非常显著的,它证明了i-基序不仅普遍存在,而且在基因组功能中扮演着重要角色。

  i-基序是一种不同于经典双螺旋形状的DNA结构。当同一DNA链上的胞嘧啶字母相互配对时,就会形成i-基序,从而形成从双螺旋中伸出的四链扭曲结构。

  团队发现,i-基序并非随机分布,而是集中在基因组的关键功能区域,包括控制基因活动的区域,在调节基因活性方面发挥动态作用。

  研究还发现,i-基序编码了某些在癌症中难以治疗的目标蛋白,而这些i-基序也广泛分布在与难治性癌症相关的序列附近,这为透过针对i-基序来治疗癌症提供了潜在的策略。

  团队表示,他们将设计出针对i-基序影响基因表现的药物。这项研究展示了基础研究与技术创新如何结合在一起,推动科学发现进入一个新的阶段。

  【总编辑圈点】

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  DNA双螺旋结构的发现,在生命科学领域具有里程碑意义,科学家以此开启了分子生物学的新纪元。不过,可以肯定的是,在神秘的遗传物质世界里,依然蕴藏着无数未知的奥秘等待科学家去探索。 i-基序的发现便是一个典型案例。它更进一步揭开了DNA结构的神秘面纱,帮助我们了解该结构与人类重大疾病之间的微妙关系,并有望助推癌症基因疗法进一步成熟。

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AI工具精準描述細胞代謝狀態 為研發疾病新療法提供“利器”

北京9月3日电(记者张梦然)瑞士洛桑联邦理工学院领导的团队创​​建了一个基于AI的工具RENAISSANCE,其可结合各种类型的细胞数据,准确描述细胞代谢状态,从而帮助人们更精准地理解细胞功能。 RENAISSANCE是计算生物学的重大进步,为健康研究和生物技术创新开辟了新途径。

  现代生物学产生了大量有关各种细胞活动的资料集。这些数据集提供了对不同细胞功能的洞察,例如基因活动和蛋白质水平。然而,如何整合和理解这些数据集以了解细胞代谢,一直是一项高难度挑战。

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  动力学模型透过对细胞代谢的数学表达,提供了一种解读复杂数据的新方法。它们可作为详细的地图,描述分子在细胞内如何相互作用和转化,以及物质如何随着时间的推移转化为能量和其他产物。

  此次团队利用RENAISSANCE创建了准确反映大肠杆菌代谢行为的动力学模型。该工具成功产生了与实验中观察到的代谢行为相匹配的模型,模拟了细菌在生物反应器中如何随时间调整其代谢。

  研究同时证明,即使受到遗传和环境条件的干扰,动力学模型也能保持稳定。模型能可靠地预测细胞对不同情境的反应,进而增强其在研究和工业应用上的实际效用。

  团队表示,代谢组学和蛋白​​质组学只能检测和量化有限数量的代谢物和蛋白质,这会带来数据覆盖不足的问题。能整合和协调各种来源资料的建模技术,则可弥补此限制并增强对整个生命系统的理解。

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  从长远角度来看,RENAISSANCE能准确模拟细胞代谢具有重大意义,它为人类研究代谢变化提供了强大的工具,并有助于开发新的治疗方法和生物技术。

  【总编辑圈点】

  细胞代谢是细胞内所发生的一系列用于维持生命的有序化学反应的总称。生物体的生长、繁殖和衰老,都和代谢密切相关。细胞一刻不停地运作,而发生在细胞内的代谢过程又异常复杂。各种代谢物,各种蛋白质…要对其进行模拟,难度可想而知。计算机科学的进步,为生物学的许多问题带来新的解决方案。此次,研究团队创建了基于AI的工具,其可协助准确模拟细胞代谢,为研究代谢变化提供指引。了解代谢,我们就掌握了生命活动的密码

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