男科疾病的治療方法，與其他臨床各科一樣，是在辨證施治理論指導下，根據辯證所明確的病因病機，制訂相應的治療方法，選用有效的方藥，以祛除病邪，調整和恢復全身機能，從而促使患者恢復健康。常用的治法分述如下：
一、滋腎補腎
《諸病源候論·虛勞候》指出，男子腎氣虧損有七個癥狀，稱之為“七傷”：“七傷者，一日陰寒，二日陰痿；三日裡急；四日精連連（精易滑出）；五日精少，陰下濕：六日精清（精氣清冷，精液稀薄）；七日小便苦數，臨事不舉（小便頻數，淋瀝不斷或尿中斷）。”
凡腎陰不足、或真陰虧損者，宜滋腎養陰，填精益髓。常用藥物如地黃、制首烏、女貞子、山茱萸、枸杞子等，代表方劑如左歸飲。若陰精虧損，陰不斂陽，而致陽失潛藏，出現陰虛陽亢諸侯者，益滋陰潛陽，即“壯水之主，以制陽光”，可於左歸飲中選加生龍骨、生牡蠣、灸鱉甲之類。
凡腎陽不足、命門火衰者，宜溫腎補腎，即“益火之源，以消陰翳。”常用藥物如肉桂、附子、巴戟子、肉蓯蓉、鹿角膠、補骨脂、菟絲子、杜仲等，代表方劑如右歸丸。取其“孤陽不生，獨陰不長”之意，使陽有所附，陰得溫化，陰陽協調，其病乃愈。
若腎中陰陽俱虛者，則宜陰陽雙補。上述藥物可參合使用。
總之，滋腎補腎是治療男科疾病的重要法則。診療時，還必須掌握陽中求陰或陰中求陽。如《景嶽全書》雲：“善治陽者，必於陰中求陽，則生化無窮。善補陰者，必於陽中求陰，則泉源不竭。”臨證時應著重細心體會和運用。
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二、疏肝養肝
凡肝失條達、肝氣鬱結者，宜疏肝解鬱，或調理肝氣。常用藥物如：柴胡，香附、青皮、川楝子、橘葉、延胡索、烏藥、木香、枳殼等。代表方劑如聚香飲子，取其木鬱達之之義。
凡肝鬱化火者，則宜疏肝清熱。常用藥物如：川楝子、青蒿、丹皮、梔子、黃芩等，代表方劑有丹梔逍遙散。若肝經濕熱、肝膽火盛者，法當喜瀉肝清熱，方如龍膽瀉肝湯。
三、溫經散寒
寒主收陰、凝澀。寒邪客於經絡，常可引起男科疾患。故溫經散寒一法亦為臨床所常用。
寒有實寒、虛寒之分。實寒治宜溫散寒邪；虛寒治宜溫經散寒。常用藥物如肉桂、附子、桂枝、細辛、小茴香、吳茱萸、幹薑之類。代表方劑如當歸四逆加吳茱萸生薑湯。臨床視其虛、實之差異而隨證加減。
四、清熱解毒
感受邪熱，蘊結成毒，治宜清熱解毒。常用藥物有：金銀花、蒲公英、紫草根、紫花地丁、敗醬草、魚腥草、苦參、黃連、黃柏、土茯苓、野菊花等。代表方劑如涼血解毒丸。熱邪傷人，最易劫陰，故在治療中常須佐以生地，玄參等養陰清熱之品，使熱去而陰不傷。
五、滲利水濕
濕邪為病，多責之於脾、腎二臟。若脾虛失運，若脾虛失運，水濕停滯為患，則宜健脾升陽，淡滲利濕。常用藥物如：白術、茯苓、豬苓、車前、澤瀉、萆薢、薏苡仁等。若為腎陽不振，不能溫化水濕，治宜溫腎化濕或溫陽行水。常用藥物有：巴戟、茯苓、附子、肉桂、桂枝等。
以上僅為男科常用的幾種治療法則，臨證時，根據病情靈活掌握，不可執於一方一法，必須細心體認，辨證施治，才能取得預期效果。
